Ciao Sergi,
io ho vissuto e lavorato quasi 2 anni in baviera per conto di una web agency tedesca e so che le tasse, nel mio caso, le pagavo in Germania.
Sinceramente non so come funzioni nel caso tu lavorassi per aziende site in Italia, davvero non ti saprei dire.
Un organo competente in materia è il patronato ACLI, non se se ne hai uno nelle vicinanze di casa (ci sono anche in Germania al limite), ed assistono in casi di italiani lavoratori all'estero.
Cmq, visto che stai andando in Germania ti conviene iniziare a lavorare anche per clienti tedeschi, pensiero spassionato.