Il file wp-config -sample.php non è colpevole di nulla, lo puoi anche cancellare che non serve a nulla, è, ripeto, solo un esempio. Non so cosa hai combinato, hai scritto che hai modificato quel file ma sicuramente ti sarai sbagliato a scrivere e avrai rinominato o modificato il file wp-config.php che è quello che serve.
Poi se vuoi cancellare tutto e caricare un backup di due settimane fa è una libera scelta tua ma secondo me non serve, basterebbe che facessi la cosa inversa a quella che hai fatto se ne sei a conoscenza visto che da come l'hai raccontata è inspiegabile.