Il mio sistema (un po casereccio ma funge)...
Accedi tramite FTP e ordini per "ultima modifica"; dovrai farlo per tutte le cartelle singolarmente.
Nella nuova disposizione t'è facile individuare i files infetti; infatti se non hai effettuato aggiornamenti di Wordpress, quelli infetti saranno gli ultimi modificati.
Ovviamente procedi a modifica in locale tenendo presente che quasi sicuramente troverai questo codice aggiuntivo, ad inizio file.

PS: il mio NOD32 non mi faceva accedere a questa pagina; prova ad utilizzare il tag CODICE invece del quote!!!

Per vedere se ci sono temi già trattati usa il tasto cerca, magari con i filtri avanzati trovi qualcosa che ti interessa.

Per la realizzazione dello script si tratta di una cosa semplice, quindi puoi sia realizzarla tu, che (ovemai non ritieni di essere in grado) affidarti a qualche freelance.

Il consiglio che sento di darti è quello di valutare una soluzione flessibile, che permetta in un futuro di aggiungere o rimuovere una struttura o una domanda senza incidere sul database.

In bocca al lupo.