Ciao,
i checkbox possono funzionare come un array impostando come name qualcosa[] e imposti come value l'id.
Lato php un array con gli id ad esempio e puoi utilizzarlo come meglio credi.

Ciao ho provato a fare così, però l'array non saprei come implementarlo:

<form enctype="multipart/form-data" name="formcancella" action="<?=$PHP_SELF?>" method="post">

<?php
$id = $row2[id_anagrafica];
?>

<table width="230" height="30" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
<tr>
<td width="140" align="left"><input type="checkbox" name="delete[]" value="<?php echo($id); ?>"> <span class="testo_rosso_bold3">Elimina <?=$id?></span></td>
<td width="90">

<input type="hidden" name="cancella" value="1">

 <input name="submit" type="submit" class="pulsante" value="cancella">
 

    </td>
  </tr>
</table> 

</form>

<?
if ($cancella==1){

$comma_separated = implode(",", $_POST['delete']);

$sql = "DELETE FROM a_anagrafica WHERE a_anagrafica.id_anagrafica IN (".$comma_separated.")";

mysql_query($sql,$conn) or die (mysql_error());

}
?>

Mi sembra perfetto cosi, qual'è il problema che riscontri?

scusa hai ragione va bene così, ti chiederei l'ultima costesia.
L'anagrafica si trova in 3 tabelle: a_anagrafica, a_login, a_ana_preferenze

come faccio a cancellare in una volta sola i 3 record che si trovano rispettivamente nelle 3 tabelle?

questa è la query relazionale:

SELECT a_anagrafica., a_login., a_ana_preferenze.*

    FROM a_anagrafica 
    
    INNER JOIN a_login 
    ON a_anagrafica.id_anagrafica = a_login.id_anagrafica 
    
    LEFT JOIN a_ana_preferenze 
    ON a_login.id_login = a_ana_preferenze.id_login

così potrebbe andare?

<?
if ($cancella==1){

$comma_separated = implode(",", $_POST['delete']);

$sql1 = "DELETE FROM a_anagrafica WHERE a_anagrafica.id_anagrafica IN (".$comma_separated.")";

$sql2 = "DELETE FROM a_login WHERE a_login.id_anagrafica IN (".$comma_separated.")";

$sql3 = "DELETE FROM a_ana_preferenze WHERE a_ana_preferenze.id_login IN (".$comma_separated.")";

mysql_query($sql,$conn) or die (mysql_error());

}
?>

anche se quest'ultima query che ho postato non mi convince molto perchè i record non sono relazionati tra loro in questo modo ma sono indipendenti

Si volendo si può fare cosi, fai attenzione che il mysql_query lo hai richiamato una sola volta.
I delete puoi farli anche con dei join:
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/delete.html

ok ho visto e poi fatto una prova, può andare bene?

DELETE a_anagrafica,a_login,a_ana_preferenze

FROM a_anagrafica

INNER JOIN a_login
ON a_anagrafica.id_anagrafica = a_login.id_anagrafica

INNER JOIN a_ana_preferenze
ON a_login.id_login = a_ana_preferenze.id_login

WHERE a_anagrafica.id_anagrafica = '".$id."'

Si dovrebbe essere corretta, però hai messo un singolo id invece di usare IN (id1,id2)

ho fatto un test ma non mi ha cancellato niente

Fai prima una query SELECT cosi vedi cosa prende e se c'è qualche errore sui JOIN, io non posso sapere com'è strutturato il tuo database quindi non sò dirti cosa non va. Dopo la modifichi in DELETE facilmente.

questo è uno dei risultati delle query:

SELECT a_anagrafica., a_login., a_ana_preferenze.* FROM a_anagrafica INNER JOIN a_login ON a_anagrafica.id_anagrafica = a_login.id_anagrafica INNER JOIN a_ana_preferenze ON a_login.id_login = a_ana_preferenze.id_login WHERE a_anagrafica.id_anagrafica = '1902'

quindi praticamente mi stampa solo l'id di a_anagrafica.id_anagrafica è giusto che sia così?

questo è il codice x stampare a video la query:

<?php
$sql = "SELECT a_anagrafica., a_login., a_ana_preferenze.*

FROM a_anagrafica

INNER JOIN a_login
ON a_anagrafica.id_anagrafica = a_login.id_anagrafica

INNER JOIN a_ana_preferenze
ON a_login.id_login = a_ana_preferenze.id_login

WHERE a_anagrafica.id_anagrafica = '".$id."'";

mysql_query($sql,$conn) or die (mysql_error());

echo $sql;
?>

Tu devi eseguirla direttamente sul database (Tramite phpMyAdmin ad esempio) e vedere se restituisce qualcosa oppure no, perchè se non restituisce nulla significa che qualche join fatto cosi non va bene.

fatto, ma anche tramite phpMyAdmin non succede nulla

Significa che i JOIN non sono fatti correttamente, controlla bene che ti serva un INNER JOIN invece di un LEFT JOIN. E anche che i campi in cui unisci sono corretti.

ok ora funziona grazie dell'aiuto

scusa mi sono accorto solo ora che me ne cancella solo uno per volta anche se ne seleziono più contemporaneamente. Forse può dipendere dal pulsante cancella e dal form che li devo mettere fuori il ciclo della ricerca?

Puoi postare il codice completo?